El Biotopo Protegido Naachtun-Dos Lagunas es un área protegida ubicada en el departamento de Petén, Guatemala. Es parte de la Reserva de la Biosfera Maya y tiene una superficie de 49,500 hectáreas. El biotopo fue creado para la protección del venado de cola blanca, y alberga una gran variedad de flora y fauna, incluyendo jaguares, tapires, monos, cocodrilos y más de 300 especies de aves.
Se encuentra en una zona de transición entre la selva tropical húmeda y la selva tropical seca. El paisaje es variado, con bosques, sabanas y humedales. El biotopo también incluye dos lagunas, Dos Lagunas y El Cacao.
Es un importante sitio arqueológico, con los restos de la ciudad maya de Naachtun. La ciudad fue habitada desde el Preclásico Tardío (ca. 400 aC) hasta el Postclásico (ca. 900-1524 dC).
El biotopo es un destino turístico popular, y ofrece una variedad de actividades, incluyendo caminatas, campamentos y observación de la vida silvestre.
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